在受孕第二週時，胚胎成長的速度漸緩慢，主要是開始建立有效的交換系統，以供胚胎營養。在第三週時，接合子已著床，胚胎呈現一個圓盤型的胚胎層，它是由二層組織組成，即胚胎外胚層和胚胎內胚層，原始線(Primitive Streak)由外胚層及內胚層之間細胞遷移而產生，往後並形成中胚層。
在第三週時除了三個胚胎層的形成外，胚胎從圓盤形增長為梨形，頭端較寬而尾端較窄。外胚層的中線形成神經板(Neural Plate)，後來逐漸發育成頭部及脊髓。脊索(Notochord)是由原始線發育而來的。脊索將形成胚胎的中軸及原始的骨骼支柱。中胚層在脊索兩邊變厚，形成二條垂直線，於第三週結束時，中胚層形成成對的體節(Somites)，後來可發展為脊柱的脊椎(Verbebra)。
